Détection et characterisation chez la tomate de variants dans des genes impliqués dans les flux xylémiens (Tom-tom)

Coordination: Mylène Durand-Tardif

Partenaire industriel: Gautier Semences

Le projet Tom-Tom avait l’objectif d’obtenir des lignées de tomate avec une meilleure efficacité d’utilisation en eau. Pour cela, des orthologues de deux gènes d‘Arabidopsis (AtESK1, AtKAK), impliqués dans la formation ou le maintien du xylème devait être identifiés ainsi que des variants de type TLLING. Les variants devaient être caractérisés quant à leur tissu xylémien et en réponse à un déficit hydrique. Des triples et doubles mutants seront sans doute nécessaires s’il y a redondance de fonction pour les orthologues. L’URGV s’est occupée d’isoler des lignées avec des SNP dans les deux gènes orthologues de KAK chez la tomate. Gautier Semences, a isolé les lignées homozygotes et multiplié le matériel végétal des lignées mutantes Lekak1 et Lekak2. L’IJPB avait la mission de caractériser ces lignées : morphométrie et performances de croissance dans des conditions contrôle et de déficit hydrique, étude de la structure et la composition des vaisseaux de xylème, observation des trichomes et de mesure de la conductivité hydraulique des tiges. La réponse de Lekak1 et Lekak2 au déficit hydrique a été observée, grâce à un test de réponse à la sécheresse sur plantule, mis au point à l’IJPB, adapté de celui pratiqué chez Arabidopsis. Quatre mutants se sont révélés intéressants, pour lesquels les performances en situation de sécheresse étaient favorable et/ou une interaction Génotype x Traitement était significative entre un mutant et sa lignée isogénique sauvage pour un ou plusieurs caractères. Ces mutants ont été intégrés dans un essai de phénotypage au Maroc, piloté par Gautier Semences, afin d’étudier la qualité du fruit ainsi que le rendement. Tomtom a renforcé notre pratique de collaboration avec Gautier Semences et nous recourrons à nouveau à une demande de soutien quand les doubles et triples mutants Leesk et Lekak seront disponibles. Tomtom a renforcé notre pratique de collaboration avec Gautier Semences et nous recourrons à nouveau à une demande de soutien quand les doubles et triples mutants Leesk et Lekak seront disponibles.