Summer School 2018

Pour cette troisième école d’été SPS, 25 jeunes chercheurs de très haut niveau scientifique ont bénéficié pendant une semaine d’un enseignement interdisciplinaire dans les domaines de l’épigénétique végétale, du développement des plantes, de la biologie de l'ARN et de la structure de la chromatine, ainsi que des outils bio-informatiques associés à l’analyse de ce type de données.

Une session de présentation de posters autour d’un apéritif d’accueil a tout d’abord permis aux participants de briser la glace et découvrir leurs sujets d’étude respectifs. Puis, à travers des conférences données par des scientifiques de renom, les jeunes chercheurs ont pu observer un large aperçu des dernières avancées dans le domaine et identifier les principales questions en suspens. Des sessions pratiques d’analyse bio-informatique de données d'épigénomique sont venues compléter ces modules théoriques.

N’oublions pas également une journée dédiée à la visite de laboratoires du réseau SPS puis à une découverte du Château de Versailles et qui s’est terminée par un dîner pendant lequel les participants se sont enflammés en regardant la demi-finale de la coupe du monde de football…

Un programme riche et dense qui a laissé les participants épuisés mais très satisfaits de cette école d’été !

Thématiques et intervenants invités

1) Base moléculaire de l’épigénétique végétale / Méthodologies
Bref rappel historique sur l’épigénétique, introduction sur la méthylation de l’ADN, les modifications des histones, l’organisation spatiale de la chromatine chez les plantes, les longs ARN non-codants, les petits ARN végétaux, l’épitranscriptomique et les méthodologies associées.

• Jonathan Weitzman (Epigenetics & Cell Fate Centre, France)
• Aline Probst (Génétique Reproduction & Développement, GReD, France)
• Chang Liu (Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen, ZMBP, Germany)
• Cécile Antonelli (Laboratoire Génome et Développement des Plantes, LGDP, France)

2) Quelle est la relation entre destin cellulaire et épigénétique ?
Régulations de la chromatine liées à la morphologie de la plante, à la photomorphogénèse, à la lignée germinale et à la floraison
+ Session pratique : Analyse bioinformatique de données ChIPseq

• Christel Carles (Laboratoire de Physiologie Cellulaire & Végétale, PCV, France)
• Fredy Barneche (Biology Institute of the École Normale Supérieure, IBENS, France)
• Ortrun Mittelsten Scheid (Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology, GmbH, Austria)

3) Rôle de l’épigénétique dans l’intégration des signaux environnementaux
Stress biotiques et abiotiques, avec une emphase particulière sur la mémoire épigénétique du stress après le stress
+ Session pratique : Analyse de petits ARN

• Leandro Quadrana (Biology Institute of the École Normale Supérieure, IBENS, France)
• Jean Molinier (Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, IBMP, France)
• Lionel Navarro (Biology Institute of the École Normale Supérieure, IBENS, France)
• Jose Gutierrez-Marcos (University of Warwick, UK)

4) Épigénétique transgénérationnelle & Amélioration des plantes
En particulier, variabilité épigénétique inductible chez les plantes cultivées, utilisation de l’épigénétique dans l’amélioration des plantes, rôle de la variabilité épigénétique naturelle dans la spéciation végétale
+ Session pratique : Analyses de méthylations ADN

• Pierre Baduel (Biology Institute of the École Normale Supérieure, IBENS, France)
• Germán Martinez (Swedish University of Agricultural Sciences, Sweden)
• Étienne Bucher (Research Institute of Horticulture and Seeds, IRHS, France)

Organisateurs

Nicolas Bouché (Institut Jean-Pierre Bourgin)
Martin Crespi (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay)
Moussa Benhamed (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay)

Intervenants du LabEx SPS

• Nicolas Bouché (Institut Jean-Pierre Bourgin, IJPB, France)
• Martin Crespi (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)
• Hervé Vaucheret (Institut Jean-Pierre Bourgin, IJPB, France)
• Moussa Benhamed (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)
• Abdel Bendahmane (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)
• David Latrasse (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay)
• Filipe Borges (Institut Jean-Pierre Bourgin, IJPB, France)
• Lorenzo Concia (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)
• Christine Lelandais (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)
• Thomas Blein (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)
• Jérémie Bazin (Institute of Plant Sciences Paris-Saclay, IPS2, France)

Programme

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