Transcriptome

Prestations

La plateforme transcriptomique POPS (Plateforme transcriptOmique de l’IPS2) réalise des projets d’étude du transcriptome en collaboration avec des équipes de recherche nationales et internationales. Elle offre une expertise pour l’analyse de l’expression comparative des gènes par l’utilisation du séquençage à haut débit de l’ARN, ou RNA-seq. Cette offre est complétée par l’analyse bio-informatique et statistique des données brutes permettant l’analyse quantitative du transcriptome.

Principaux équipements

• NextSeq500, Illumina
• MinION, Oxford Nanopore
• Chromium, 10X Genomics
• Biomek FX liquid handler, Beckman Coulter
• 2x Bioanalyzers, Agilent
• Fragment Analyser, Agilent (bientôt sur la plateforme)
• CLARIOstar, BMG Labtech
• Qubit, Life Technologies
• M220 Covairs, LGS Genomics
• PippinHT, SageScience
• Serveurs d’analyse

Responsable de la plateforme

Responsable scientifique: Etienne Delannoy
Responsable opérationnelle: Médine Benchouaïa
+33 (0)1.69.15.77.19
pops.ips2[at]u-psud.fr

Site Web

http://ips2.u-psud.fr/fr/plateformes/spomics-interatome-metabolome-transcriptome/pops-plateforme-transcriptomique.html

Adresse

Plateforme transcriptome
IPS2
Bâtiment 630
Avenue des Sciences, Plateau du Moulon
91190 Gif-sur-Yvette Cedex
France